El dulce, Las batatas anaranjadas con almidón son ingredientes sabrosos y nutritivos para papas fritas, guisos y empanadas. Aunque los humanos han estado cultivando batatas durante miles de años, los científicos aún no saben mucho sobre la composición proteica de estos tubérculos. En ACS ' Revista de investigación del proteoma , Los investigadores han analizado el proteoma de las hojas y raíces de la batata, y en el proceso, han revelado nuevos conocimientos sobre el genoma de la planta.

La batata Ipomoea batatas , Lam.) Es un alimento básico en algunas partes del mundo, además de ser utilizado para la alimentación animal y productos industriales, como los biocombustibles. La planta tiene un genoma sorprendentemente complejo, codificando más genes predichos que el genoma humano. La batata también tiene una composición química compleja, con un bajo contenido de proteínas en las raíces (la parte que comen las personas) y muchos metabolitos secundarios en las hojas, lo que dificulta la extracción de cantidades suficientes de proteínas para el análisis. Sorina y George Popescu y sus colegas querían ver si un enfoque de "proteogenómica" —analizando tanto la proteína como los datos genéticos juntos— podría ayudarlos a comprender mejor la composición de las raíces y hojas de la batata.

El equipo extrajo proteínas de muestras de raíces y hojas utilizando dos métodos diferentes y las cortó en péptidos. que analizaron con cromatografía líquida y espectrometría de masas. Los investigadores identificaron 3, 143 proteínas únicas de hojas de batata y 2, 928 de raíces. Cuando compararon los datos proteómicos con el genoma de la batata, identificaron algunas regiones en la secuencia genómica publicada donde sus datos podrían proporcionar información mejorada. Por ejemplo, el análisis predijo 741 nuevas regiones codificantes de proteínas que anteriormente no se pensaba que fueran genes. El grupo dice que los resultados podrían usarse para ayudar a caracterizar y biofortificar aún más el tubérculo.