Sin embargo, es importante tener en cuenta que la clasificación de los organismos en los reinos es un sistema algo desactualizado. Los sistemas de clasificación modernos, como el sistema de tres dominios, han reemplazado el sistema tradicional de cinco reyes. En el sistema de tres dominios, los procariotas se dividen en dos dominios: bacterias y arquea .

Entonces, si bien "Monera" todavía se usa a veces para referirse a procariotas, es más exacto decir que los procariotas pertenecen a las bacterias y arqueas de dominios.