1. Secuenciación del genoma viral:
- Los científicos secuencian el genoma viral completo de muestras de COVID-19 recolectadas de pacientes.
- Para determinar la secuencia genética del virus se utilizan tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, como la secuenciación de próxima generación (NGS).
- Esto proporciona una comprensión integral del genoma viral e identifica mutaciones, inserciones o eliminaciones específicas que pueden haber ocurrido.
2. Análisis filogenético:
- El análisis filogenético implica la construcción de árboles evolutivos basados en secuencias del genoma viral.
- Al comparar las secuencias genéticas de diferentes muestras de COVID-19, los científicos pueden determinar la relación y la historia evolutiva del virus.
- Esto ayuda a rastrear los orígenes geográficos y las rutas de transmisión del virus.
3. Identificación de variante:
- A medida que evoluciona el virus COVID-19, surgen nuevas variantes genéticas.
- Los científicos monitorean continuamente estas variantes comparando las secuencias del genoma viral con la secuencia de referencia del SARS-CoV-2 original.
- Las variantes con cambios significativos o impacto potencial en el comportamiento, la transmisibilidad o la respuesta inmune del virus se designan como "variantes preocupantes" (VOC) o "variantes de interés" (VOI) para una mayor investigación.
4. Seguimiento de mutaciones:
- Mediante la vigilancia genómica, los investigadores rastrean mutaciones específicas en el genoma viral a lo largo del tiempo.
- Las mutaciones en determinadas regiones del genoma viral, como la proteína de pico, pueden afectar la capacidad del virus para unirse a las células huésped y evadir las respuestas inmunitarias.
- El seguimiento de las mutaciones ayuda a comprender las posibles implicaciones para la eficacia de las vacunas, las pruebas de diagnóstico y las estrategias de tratamiento.
5. Epidemiología genómica:
- La epidemiología genómica combina la secuenciación del genoma viral con datos epidemiológicos.
- Al analizar la diversidad genética y la distribución de las cepas de COVID-19 en diferentes regiones geográficas, los científicos pueden identificar los factores que influyen en la transmisión y propagación del virus.
- Esta información respalda las intervenciones de salud pública y las estrategias de contención.
6. Monitoreo en tiempo real:
- Algunos grupos de investigación y agencias de salud pública han establecido sistemas de vigilancia que proporcionan un seguimiento en tiempo real de la evolución genética del COVID-19.
- Estos sistemas recopilan y analizan continuamente secuencias del genoma viral para rastrear variantes emergentes e informar las políticas y la toma de decisiones de salud pública.
Al emplear estos métodos de seguimiento genético, los científicos pretenden controlar la evolución de la COVID-19, identificar riesgos potenciales asociados con nuevas variantes y contribuir a los esfuerzos en curso para combatir la pandemia de forma eficaz.
