Un equipo de investigadores de la Universidad de California ha encontrado una forma de sintetizar múltiples genes a partir de un grupo de oligonucleótidos generados por microarrays. En su artículo publicado en la revista Ciencias , el grupo describe su técnica, llamado DropSynth, que tan bien funciona y sus inconvenientes.

La síntesis de genes se ha vuelto tan popular que ahora hay empresas que lo hacen para ganarse la vida, pero sigue siendo una propuesta costosa:los métodos actuales requieren coser pequeñas hebras en secuencias una por una después de que se hayan creado. En este nuevo esfuerzo, los investigadores informan de un enfoque de un solo recipiente para la síntesis de genes que podría conducir a reducir los costos.

En la actualidad, la síntesis de genes se realiza mediante un microarray, producir oligonucleótidos de ADN, que luego deben coserse juntos. El equipo de UoC también comenzó con un microarray, pero primero dieron a los oligonucleótidos una longitud de identificación de secuencia genética, que describen como un "código de barras". Próximo, agregaron microperlas con códigos de barras complementarios que podían extraer oligonucleótidos coincidentes de un conjunto de diferentes tipos de oligonucleótidos. El resultado fue un grupo de microperlas, cada uno de los cuales tenía un pequeño grupo de oligonucleótidos del mismo tipo unidos. Luego, el equipo encerró cada una de las microperlas (y su grupo de oligonucleótidos) en una gota de emulsión usando lo que describen como un vórtice de mezcla de oligonucleótidos y aceite, durante 30 segundos. Después, las enzimas indujeron a todos los oligonucleótidos en una sola gota a fusionarse (a través del ensamblaje del ciclo de la polimerasa), resultando en una secuencia deseada. A continuación, las secuencias se retiraron de la emulsión listas para su uso.

El proceso es mejor que los métodos convencionales, el equipo sugiere, debido a que ofrece acceso a un acervo genético esencialmente al mismo costo que un conjunto de oligonucleótidos, no aporta mucho. Desafortunadamente, hay una desventaja bastante grande. El proceso, ellos notan, es "desordenado, "porque solo tiene una eficiencia aproximada del 5 por ciento, lo que no es lo suficientemente bueno para su uso en procesos de fabricación. En una nota más positiva, el método podría utilizarse para crear grandes bibliotecas de genes para diversos fines, a muy bajo costo. También podría usarse en esfuerzos de investigación, particularmente aquellos involucrados en el diseño de proteínas.

© 2018 Phys.org