1. Atmósfera superior: Esta capa se compone principalmente de hidrógeno y helio, y es donde se encuentran la gran mancha oscura y otras tormentas.
2. Atmósfera inferior: Esta capa es más gruesa y más densa que la atmósfera superior, y contiene metano, amoníaco y hielo de agua.
3. manto: Esta capa se compone principalmente de agua, metano y amoníaco, y se cree que es extremadamente caliente y densa.
4. núcleo: Se cree que esta capa es un núcleo sólido y rocoso que es aproximadamente el doble del tamaño de la Tierra.
5. núcleo interno: Esta capa es el centro mismo de Neptuno, y se cree que está compuesta de hierro y níquel.
Si bien hay cinco capas distintas, es importante tener en cuenta que los límites entre ellas no están muy definidos.