*El equipo de investigación identifica un nuevo fenómeno que conduce a una mejor comprensión del método*
La secuenciación de ADN es una parte clave de la biología moderna y se utiliza en muchos contextos, como el diagnóstico médico, la ciencia forense y la biología evolutiva. Recientemente han surgido muchas técnicas nuevas para secuenciar ADN, que ofrecen muchas ventajas sobre la secuenciación de Sanger, anteriormente dominante. Estas nuevas técnicas emplean métodos que son más rápidos y más baratos, y que a menudo permiten secuenciar fragmentos de ADN en cuestión de horas. La secuenciación de nanoporos utiliza nanoporos biológicos o sintéticos para forzar moléculas individuales de ADN o ARN a través de un poro de proteína. Luego, este proceso se puede utilizar para establecer la secuencia de nucleótidos a lo largo de una cadena de ADN o ARN.
Un nuevo estudio realizado por el Dr. Sebastian Getfert, el Dr. Jörg Bewarder, ambos postdoctorados en el Departamento de Física, y el Profesor Ulrich Rant, jefe del departamento, ha identificado un nuevo fenómeno que influye en la detección de nanoporos y, por tanto, mejorará la comprensión y aplicación de esta tecnología.
Actualmente, la detección de nanoporos en poros biológicos se basa en la desaceleración controlada de la translocación de moléculas de ADN mediante la aplicación de un campo eléctrico sobre el nanoporo. Los investigadores muestran mediante simulaciones de dinámica molecular a múltiples escalas que, en presencia de este campo, partes del ADN pueden salir transitoriamente del poro y formar un bucle en el disolvente, lo que afecta a la señal de ADN medida y puede provocar dificultades en la interpretación de los datos.
Getfert y Rant:"La detección de nanoporos es una tecnología muy prometedora y nuestro trabajo contribuye a la comprensión fundamental del proceso de detección de nanoporos, lo que en última instancia permite a los científicos desarrollar y optimizar aún más el método".
El estudio del departamento de física fue publicado recientemente en la reconocida revista científica Nature Communications.