1. Enlace de hidrógeno: El factor más importante es la formación de enlaces de hidrógeno entre los grupos de amida de la columna vertebral (N-H) y carbonilo (C =O) de aminoácidos separados cuatro residuos a lo largo de la hélice. Estos enlaces de hidrógeno crean una red fuerte que mantiene unida la hélice.
2. Interacciones de Van der Waals: El empaque cercano de las cadenas laterales de aminoácidos dentro de la hélice contribuye a la estabilidad a través de las interacciones Van der Waals. Esta interacción surge de las fluctuaciones temporales de las nubes de electrones alrededor de los átomos, lo que lleva a una atracción débil pero aditiva entre grupos no polares.
3. Interacciones electrostáticas: Las interacciones electrostáticas entre las cadenas laterales cargadas pueden influir en la estabilidad de la hélice. Por ejemplo, las interacciones entre residuos cargados positivamente y residuos cargados negativamente pueden estabilizar la hélice.
4. Efecto hidrofóbico: Las cadenas laterales no polares tienden a agruparse en el interior de la hélice, lejos de las moléculas de agua circundantes. Este efecto hidrofóbico contribuye a la estabilidad general de la hélice.
5. Disrupción de prolina y glicina: La prolina, con su estructura cíclica, interrumpe el patrón regular de enlace de hidrógeno en la hélice. La glicina, con su pequeño tamaño, también puede interrumpir la hélice debido a su flexibilidad.
Factores que afectan la estabilidad:
* secuencia de aminoácidos: La secuencia de aminoácidos en una proteína afecta significativamente la formación de hélices y la estabilidad. Ciertos aminoácidos son más propensos a la formación de hélice que otros.
* Condiciones de solvente: La presencia de ciertos solventes o iones puede alterar el enlace de hidrógeno e influir en la estabilidad de la hélice.
* Temperatura: El aumento de la temperatura puede alterar los enlaces de hidrógeno y otras interacciones, lo que lleva a un desarrollo de hélice.
En general, la estabilidad de una hélice alfa es una interacción compleja de varios factores. Mientras que la unión de hidrógeno juega un papel crucial, otras interacciones como las fuerzas de van der Waals, las interacciones electrostáticas y el efecto hidrofóbico contribuyen significativamente. La secuencia de aminoácidos específicas y las condiciones ambientales también influyen en la estabilidad de la hélice alfa.
