La electroforesis en gel es una forma de separar los fragmentos de ADN de acuerdo con su tamaño. Añada ADN de rastreo a cada muestra de ADN para ayudarlo a ver la muestra y a seguir el progreso de los fragmentos de ADN a través del gel.

Significado

Para separar fragmentos de ADN, con el propósito de midiendo su tamaño o para aislar un fragmento en particular, los científicos colocan ADN en un gel de agarosa sumergido en una solución que está cargada con una corriente eléctrica. La corriente empuja los fragmentos de ADN a través del gel, y debido a que el gel es poroso, los fragmentos de ADN más pequeños se abren camino más rápidamente. Viajan más lejos que los fragmentos más grandes en la misma cantidad de tiempo.

Propósito

El ADN es incoloro cuando está en solución en un tubo de ensayo. Para que la muestra sea más fácil de ver, tanto en el tubo de ensayo como en el gel, agrega un colorante de seguimiento coloreado a la muestra. El colorante no afecta el ADN en absoluto.

Seguimiento

El colorante de seguimiento habitual es el azul de bromofenol en una solución de glicerol al 50 por ciento. El azul de bromofenol colorea la muestra en azul brillante para que sea fácil seguir su progreso a través del gel. Cuando el colorante de seguimiento ha recorrido aproximadamente 3/4 de la longitud del gel, es hora de apagar la corriente eléctrica.

Densidad

El colorante de seguimiento es denso debido a su alta concentración de glicerol. Eso hace que las muestras de ADN se hundan en las ranuras de carga del gel, en lugar de flotar en la solución sobre el gel que transporta la corriente eléctrica.

Migración de colorante

El azul de bromofenol migra a través de una agarosa solución a aproximadamente la misma velocidad que una cadena de ADN que contiene 300 pares de bases. Si desea rastrear el progreso de cadenas de ADN más grandes, puede usar un colorante de seguimiento con xileno cianol, que migra aproximadamente a la misma velocidad que una cadena de ADN con 4.000 pares de bases.