En un artículo publicado en el Revista de química biológica , El Dr. Özdemir ha estudiado dos familias de proteínas llamadas Rho GTPasas e IQGAP, que se sabe que juegan un papel importante en la metástasis del cáncer. Estas dos familias de proteínas "sospechosas" han sido estudiadas por muchos investigadores a lo largo de los años. pero la interacción entre ellos no se había entendido completamente previamente.

Es importante comprender cómo la metástasis, la propagación del cáncer desde su sitio primario a otros órganos, tiene lugar, ya que prevenir la metástasis significa mantener el cáncer bajo control. Es por eso que el Dr. Özdemir eligió estudiar estas proteínas, que se sabe que activan la metástasis.

Requiere una gran cantidad de cálculo probabilístico, el estudio solo fue posible a través de técnicas de simulación computacional con la ayuda de computadoras muy poderosas. Los investigadores construyeron un entorno de simulación en el que muchos elementos como la densidad del agua en la celda, los iones y la estructura tridimensional de las proteínas se simularon con mucha precisión. Esto hizo posible observar cómo interactuaban exactamente las dos proteínas, los puntos en los que se dirigen, y qué cambios morfológicos provocó el enlace en las proteínas.

La simulación tomó seis meses. El estudio observó los puntos de unión y la secuencia de las dos proteínas, cómo la proteína grande encontró su pareja, y cómo se unen las dos estructuras complejas. Y se estableció que las complejas estructuras que se formaron activaron los mecanismos que desencadenaron la metástasis en las células.

El estudio del Dr. Sıla Özdemir fue probado y replicado en células cancerosas en un laboratorio por otro grupo de investigación de los Institutos Nacionales de Salud de los Estados Unidos (NIH). y los resultados mostraron una coincidencia exacta:el experimento verificó los datos producidos a través de las simulaciones por computadora. El resultado más importante de este descubrimiento será su contribución al diseño de un fármaco que se dirija al mecanismo en cuestión.

Tras su publicación en el Revista de química biológica , entre las revistas más prestigiosas en el campo, La investigación del Dr. Özdemir se publicó como parte de una colección especial de la revista de los artículos más influyentes de 2018.