Los pacientes quieren ver su información médica. Los investigadores quieren compartir sus datos.

Ahora, Los científicos de Scripps Research han lanzado una nueva tecnología diseñada para hacer que estas mediciones sean más fáciles de realizar y más accesibles para los profesionales. científicos y público en general.

"Se trata realmente de compartir datos y acelerar el proceso de descubrimiento, "dice Gary Siuzdak, Doctor., profesor de Scripps Research y coautor correspondiente de la nueva plataforma de análisis de datos abiertos XCMS / METLIN, publicado recientemente en Métodos de la naturaleza .

XCMS-MRM y METLIN-MRM representan una plataforma de análisis basada en la nube que permite a los científicos cuantificar moléculas de muestras biológicas y hacer que sus resultados estén disponibles públicamente.

"Cuando decimos 'disponible públicamente, lo decimos en serio. Cualquiera con una computadora tendría acceso, "dice Siuzdak.

Dirigida por Siuzdak, el Centro de Metabolómica y Espectrometría de Masas de Scripps Research se especializa en el uso de una técnica llamada espectrometría de masas para identificar y cuantificar moléculas pequeñas, ya sean fármacos o metabolitos naturales. Los metabolitos son fundamentales ya que interactúan con todos los niveles de la fisiología de una persona:el genoma, transcriptoma y el proteoma. Se podría decir que los metabolitos son manipuladores maestros de la fisiología y reflejan la firma de salud de un individuo.

Decenas de miles de laboratorios de todo el mundo generan datos mediante espectrometría de masas, por lo que la plataforma también podría ser útil fuera de la medicina, dicen los primeros autores del estudio Xavier Domingo-Almenara, Doctor., y J. Rafael Montenegro-Burke, Doctor., de Scripps Research. Cualquier campo que utilice espectrometría de masas podría beneficiarse de estos nuevos recursos, como las ciencias ambientales, productos farmacéuticos, forense, control alimentario y medicina deportiva, agregan.

Siuzdak y sus colegas han intentado durante mucho tiempo mantener sus herramientas de investigación gratuitas y abiertas al público. Paul Benton, Doctor., analista de bioinformática en Scripps Research y coautor correspondiente del estudio, explica que alojar su plataforma en la nube permite a cualquiera, de colaboradores a pacientes, para comprobar la validez de los resultados de la espectrometría de masas. "En una época en la que los resultados científicos se cuestionan constantemente, los datos abiertos se han convertido en una parte esencial del proceso de descubrimiento, "Dice Benton.

La idea de compartir datos abiertos se ha popularizado en los últimos años. Desde su lanzamiento en 2004, la plataforma XCMS / METLIN ha crecido a más de 25, 000 usuarios, y las moléculas en su repositorio de datos han pasado de 14, 000 a 150, 000 solo en el último año, en parte gracias a una colaboración con Calibr, una división de Scripps Research.

Los nuevos recursos aprovechan los avances que permiten a los científicos acelerar la investigación y aumentar la precisión al identificar los fragmentos clave de una molécula que la distingue.

"No hay nada más cercano a esto, "Dice Siuzdak.

El estudio, "XCMS-MRM y METLIN-MRM:una biblioteca en la nube y un recurso público para el análisis específico de moléculas pequeñas, "incluyó autores adicionales de la Universidad de Lausana; Hospital Universitario de Lausana, Hospitales Universitarios de Ginebra; Universidad de Umeå e Imperial College London.