Las ARN polimerasas son enzimas responsables de transcribir el ADN al ARN. Existen diferentes tipos de ARN polimerasas en eucariotas y procariotas, cada uno con sus funciones específicas y secuencias de reconocimiento de promotores.
* ARN polimerasa (RNAP) :La ARN polimerasa única en procariotas transcribe todos los tipos de ARN (ARNm, ARNt, ARNm).
* Estructura del promotor:
* -10 elemento (caja pribnow): La secuencia de Tataat ubicó aproximadamente 10 pares de bases aguas arriba desde el sitio de inicio de la transcripción.
* -35 elemento: La secuencia de TTGACA ubicó aproximadamente 35 pares de bases aguas arriba desde el sitio de inicio de la transcripción.
* Elementos aguas arriba: Algunos promotores tienen elementos adicionales más aguas arriba, influyendo en la eficiencia de la transcripción.
* ARN polimerasa I (Pol I): Responsable de transcribir genes de ARN ribosómico (ARNr).
* Estructura del promotor:
* Promotor central: Una región que contiene un elemento central y un elemento de control aguas arriba (UCE).
* Elemento de núcleo: Una secuencia corta ubicada aproximadamente 40 pb aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción.
* UCE: Una región ubicada aproximadamente 100 pb aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción, a menudo que contiene una secuencia conservada llamada "Elemento aguas arriba" (UE).
* ARN polimerasa II (Pol II): Transcribe genes codificadores de proteínas (ARNm) y algunos pequeños genes de ARN nuclear (SNRNA).
* Estructura del promotor:
* Promotor central: Típicamente contiene los siguientes elementos:
* Box Tata: Una secuencia conservada ubicada aproximadamente 25-30 pb aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción.
* Iniciador (INR): Una secuencia ubicada alrededor del sitio de inicio de la transcripción.
* Elemento promotor aguas abajo (DPE): Ubicado aguas abajo del sitio de inicio de la transcripción.
* bre (elemento de reconocimiento tfiib): Una secuencia ubicada aguas arriba de la caja TATA, reconocida por el factor de transcripción IIB (TFIIB).
* elementos regulatorios aguas arriba: Estos elementos pueden ubicarse cientos o incluso miles de pares de bases aguas arriba del promotor central e influir en la tasa de transcripción. Los ejemplos incluyen:
* CAAT Box: Una secuencia de consenso que une los factores de transcripción.
* GC Box: Una secuencia rica en GC reconocida por factores de transcripción.
* potenciadores: Secuencias de ADN que pueden estimular la transcripción, a menudo ubicadas lejos del promotor central.
* ARN polimerasa III (Pol III): Transcribe ARN de transferencia de transferencia (ARNt), ARN ribosómico 5S (5S rRNA) y algunos pequeños genes de ARN nuclear (SNRNA).
* Estructura del promotor:
* Promotor interno: Ubicado dentro de la región transcrita para los genes ARNt y 5S rRNA.
* promotor ascendente: Ubicado aguas arriba de la región transcrita para algunos genes snRNA.
Tabla de resumen
| ARN polimerasa | Transcripciones | Promotores |
| --- | --- | --- |
| RNAP procariota | ARNm, tRNA, rRNA | -10 elemento, -35 elemento, elementos aguas arriba |
| Eucariota Pol I | rRNA | Promotor central, UCE |
| Eucariota Pol II | ARNm, algunos snrna | Promotor del núcleo (Tata Box, INR, DPE, BRE), elementos regulatorios aguas arriba |
| Eucariota Pol III | TRNA, 5S rRNA, algunos snRNA | Promotor interno (para tRNA, 5S rRNA), promotor aguas arriba (para algunos snRNA) |
Esta tabla no es exhaustiva, ya que existen diferentes tipos de promotores y sus elementos regulatorios dentro de cada grupo. Las secuencias y estructuras específicas de los promotores pueden variar, influyendo en la eficiencia y la regulación de la transcripción.