La principal diferencia entre ARNt y ARNm es la presencia de un anticodón en el ARNt. El anticodón es una secuencia de tres nucleótidos del ARNt, que es complementario de un codón específico, que es una secuencia de tres nucleótidos del ARNm. El anticodón del ARNt es responsable de reconocer y unirse al codón complementario del ARNm durante la síntesis de proteínas. El ARNt aporta el aminoácido correcto al complejo de ARNm reconociendo los tres nucleótidos y uniendo el aminoácido correspondiente a la posición correcta en la proteína.