El principal objetivo científico de Juno es investigar la estructura interior y la dinámica de Júpiter, incluida su abundancia y distribución de agua, las propiedades de su atmósfera y los campos magnéticos generados por su rápida rotación. Para lograr estos objetivos, Juno está equipada con un conjunto de instrumentos científicos, que incluyen un magnetómetro, un radiómetro de microondas, un generador de imágenes de luz visible y un conjunto de espectrómetros.
Algunos objetivos específicos de la misión de Juno incluyen:
Determinando la estructura y composición interior de Júpiter
Estudiar la atmósfera de Júpiter, incluida su composición, patrones de circulación y estructura de nubes.
Investigando la generación del poderoso campo magnético de Júpiter
Explorando la magnetosfera polar y la aurora de Júpiter
Observando las lunas de Júpiter, incluidas las grandes lunas Ganímedes, Europa y Calisto
A través de sus observaciones y mediciones, Juno pretende proporcionar una mejor comprensión de la formación y evolución de Júpiter, y su papel en el contexto más amplio del sistema solar.