Si bien las proteínas de la superficie de las células son el objetivo de la mayoría de los medicamentos, Se necesitan métodos refinados para analizar cómo se organizan estas proteínas de membrana. Los investigadores del Karolinska Institutet han desarrollado un nuevo método analítico basado en el ADN que podría contribuir al desarrollo de futuros medicamentos para el cáncer de mama y otros tipos de cáncer. El estudio se publica en Nanotecnología de la naturaleza .

La eficacia de la mayoría de los fármacos en uso clínico se atribuye a su interacción con proteínas en las membranas celulares. Por lo tanto, es esencial comprender cómo operan estas proteínas en la salud y la enfermedad.

Muchas de las proteínas de la membrana celular se distribuyen en unidades funcionales, dominios de dimensiones nanométricas (es decir, 10 ^-6 mm).

Las proteínas de membrana se analizan mediante microscopía de superresolución, una técnica limitada por el hecho de que sólo una pequeña cantidad de proteínas de membrana, normalmente tres, pueden analizarse al mismo tiempo.

Los investigadores del Karolinska Institutet ahora han desarrollado un método que aumenta este número. Este método no basado en microscopio para analizar poblaciones enteras de células se llama NanoDeep (descifrado en escala NANO de nanodominios de proteínas de membrana).

El método se basa en el uso de análisis de ADN para traducir información sobre la organización de las proteínas de la membrana. No hay límites para la cantidad de proteínas que NanoDeep puede analizar simultáneamente. Su trabajo no solo ha permitido a los investigadores corroborar hallazgos anteriores, sino que también ha conducido a nuevos descubrimientos.

"NanoDeep tiene actualmente una resolución en el intervalo de 10 nanómetros, eso es diez mil millonésimas de metro, que supera muchos otros métodos de microscopía de superresolución, "dice la última autora del estudio, Ana Teixeira, investigador del Departamento de Bioquímica Médica y Biofísica, Karolinska Institutet. "NanoDeep tiene el potencial de aportar nuevos conocimientos sobre la regulación de la función de las proteínas de membrana".

Usando NanoDeep, los investigadores han podido describir entornos de proteínas que rodean al receptor de membrana Her2, una proteína de membrana que transmite información a las proteínas dentro de la célula.

Her2 está sobrerrepresentada en el cáncer de mama y otros tipos de cáncer. Una mejor comprensión de Her2 mejorará las posibilidades de desarrollar nuevos medicamentos que prevengan la mayoría de las recurrencias de estos cánceres.

El nuevo método se ha desarrollado para que sea lo más sencillo posible.

“Nuestro método hace que el uso de información sobre las organizaciones espaciales de las proteínas a nanoescala sea más accesible como herramienta de diagnóstico en pruebas clínicas, "dice el primer autor del estudio, investigadora postdoctoral Elena Ambrosetti. "También se puede utilizar como herramienta para desarrollar nuevos tipos de fármacos diseñados para afectar la función de las proteínas de membrana".