1. Evidencia genómica y molecular:
* Estructura de ARN ribosómico (rRNA): Las arqueas y los eucariotas comparten una estructura de ARNr más similar en comparación con las bacterias. Esta fue una de las primeras pruebas que sugieren su estrecha relación.
* Síntesis de proteínas: Tanto las arqueas como los eucariotas utilizan un conjunto similar de factores de inicio y alargamiento para la síntesis de proteínas, mientras que las bacterias usan un conjunto distinto.
* Organización de genes: Las arqueas tienen genes organizados en operones como bacterias, pero los operones en Archaea son más similares en estructura a los que se encuentran en los eucariotas.
* Histonas: Mientras que las bacterias carecen de histonas, las arqueas poseen proteínas similares a las histonas que ayudan a organizar su ADN, una característica similar a los eucariotas.
* Estructura de membrana celular: Las arqueas tienen lípidos de membrana únicos que son más similares a los lípidos eucariotas que los lípidos bacterianos.
2. Historia evolutiva:
* Análisis filogenético: Los árboles filogenéticos basados en varios marcadores moleculares (rRNA, secuencias de proteínas) colocan consistentemente a Archaea como el grupo hermano más cercano a los eucariotas. Esto sugiere un antepasado común para arqueas y eucariotas.
* Transferencia de genes horizontales: La evidencia sugiere que ha habido una extensa transferencia de genes horizontales entre arqueas y eucariotas, particularmente en las primeras etapas de su evolución.
3. Características metabólicas y celulares:
* Vías metabólicas: Las arqueas y los eucariotas comparten algunas vías metabólicas que no se encuentran en las bacterias, como la capacidad de fijar el gas nitrógeno.
* División de células: El mecanismo de la división celular en Archaea es más similar a los eucariotas que a las bacterias.
* Transcripción y traducción: Mientras que las bacterias utilizan un sistema más simple para estos procesos, las arqueas y los eucariotas tienen maquinaria más compleja.
Sin embargo, es importante tener en cuenta que:
* arquea y eucariotas son dominios distintos de la vida: No están simplemente "estrechamente relacionados":son ramas separadas en el árbol de la vida.
* La relación evolutiva entre arquea y eucariotas es compleja: Si bien hay una fuerte evidencia de su estrecha relación, también hay diferencias entre ellos. Algunos investigadores creen que el último antepasado común de Archaea y Eukaryotes probablemente era más complejo de lo que se pensaba anteriormente.
La comprensión actual es que las arqueas y los eucariotas comparten un antepasado común que divergía del linaje que conduce a bacterias. Esto hace que la arquea sea más estrechamente relacionada con los eucariotas que con las bacterias. Sin embargo, la naturaleza específica de esta relación y los eventos evolutivos que conducen a la diversificación de estos dominios aún se están estudiando activamente.