General:
* aire
* entorno
* Ambiance
* aura
* estado de ánimo
* Sentimiento
* Clima
* condiciones
Específico de la atmósfera de la Tierra:
* espacio aéreo
* Stratosfera
* troposfera
* mesosfera
* Exosfera
Figurativo:
* Vibrancia
* Buzz
* tensión
* Excitación
* intimidad
En el contexto de una obra de teatro o película:
* configuración
* etapa
En el contexto de un negocio u organización:
* cultura
* ambiente de trabajo
* Lugar de trabajo
El mejor sinónimo de usar dependerá del contexto específico en el que esté utilizando la palabra "atmósfera".