1. El grupo 2'-hidroxilo:
* ARN: El ARN tiene un grupo hidroxilo (OH) unido al carbono de 2 'de su azúcar ribosa. Este grupo hidroxilo hace que el ARN sea más susceptible a la hidrólisis , un proceso donde el agua se descompone los enlaces de fosfodiéster que conectan nucleótidos. En condiciones alcalinas, esta reacción de hidrólisis se acelera.
* ADN: El ADN carece de este grupo 2'-hidroxilo, con solo un átomo de hidrógeno (H) en esa posición en su azúcar de desoxirribosa. Esto hace que el ADN sea significativamente más resistente a la hidrólisis en ambientes alcalinos.
2. Estructura base y degradación:
* ARN: La presencia de uracilo (u) en el ARN lo hace propenso a desaminación , donde el grupo amino (-nh2) en Uracil se convierte en un grupo carbonilo (C =O). Esto convierte uracilo en citosina (C), lo que puede conducir a mutaciones. Si bien la desaminación puede pasar al ARN y el ADN, es más frecuente en el ARN debido a la presencia de uracilo.
* ADN: El ADN contiene timina (t) en lugar de uracilo. La timina es menos propensa a la desaminación que la uracilo, lo que contribuye a la mayor estabilidad del ADN.
3. Estructuras secundarias:
* ARN: La naturaleza monocatenaria de ARN le permite formar una variedad de estructuras secundarias complejas, incluidos bucles de horquilla, bucles y pseudoknots. Estas estructuras pueden ser bastante frágiles y pueden verse interrumpidas por condiciones alcalinas, contribuyendo aún más a la degradación del ARN.
* ADN: La estructura de doble cadena del ADN, con sus enlaces de hidrógeno entre las bases complementarias, proporciona una mayor estabilidad y resistencia a la interrupción alcalina.
En resumen:
La presencia del grupo 2'-hidroxilo, la inestabilidad inherente del uracilo y las estructuras secundarias más complejas y frágiles hacen que el ARN sea mucho más vulnerable a la degradación en condiciones alcalinas en comparación con el ADN.