Si bien es imposible identificar un solo inventor, Zacharias Janssen generalmente se atribuye a crear el primer microscopio compuesto alrededor de 1590 .

Sin embargo, hay un debate en torno al verdadero inventor, como:

* Hans Lippershey , un fabricante de espectáculos holandeses, presentó una patente para un telescopio en 1608, lo que sugiere que podría haber estado trabajando en instrumentos de aumento similares.

* Cornelis Drebbel , un inventor holandés, también era conocido por haber construido microscopios casi al mismo tiempo.

Es probable que la invención del microscopio haya sido un esfuerzo de colaboración, con múltiples individuos que contribuyen a su desarrollo.