Plantas
Lewis describió 260 plantas en sus diarios de viaje, la mayoría de ellas nuevas para la ciencia. Entre ellos estaban las camas azules, una planta cuyo tubérculo comestible era inmensamente significativo para tribus como el Nez Perce; y monkeyflower de Lewis, una de las muchas plantas y animales que llevan el nombre de un capitán u otro.
Birds
Lewis y Clark hicieron las primeras descripciones científicas de muchas especies de aves. El cascanueces de Clark, miembro de la familia Jay, es uno de ellos. Esta notable ave almacena semillas de pino en amplias áreas para subsistir en el invierno.
Mamíferos
Algunos de los organismos más dramáticos encontrados por la expedición fueron los mamíferos, el más famoso es el oso pardo iracundo. subespecie de oso pardo descrita por primera vez por Lewis y Clark, que desafió al Cuerpo primero en los fondos del río Missouri. También enviaron a Jefferson un perro de la pradera de cola negra, una "ardilla ladradora", como lo llamaban.
Reptiles y anfibios
Algunos primeros de sangre fría en la expedición incluyeron el La rana arbórea del Pacífico, la serpiente de cascabel de la pradera y el tritón de California.
Pez
Entre los peces que Lewis y Clark descubrieron para el mundo occidental era el chupador de la montaña, un habitante de fondo que se alimentaba de algas. en la actual Montana.