Ni siquiera los científicos están 100 por ciento seguros exactamente de cómo se forman las geodas de amatista, o cómo se forman las geodas. No ha habido mucha investigación, porque las geodas son solo divertidas anomalías científicas con pocos, si es que hay, beneficios científicos. Son rocas que parecen lisas en el exterior, pero cuando se abren revelan una cavidad en el medio llena de hermosos cristales. El consenso científico general es que las geodas de amatista se crean en un proceso de dos pasos. Primero, está la formación de la cavidad y luego la formación de los cristales.
Se forman cavidades de gas

Una geoda de amatista es una roca hueca con cristales de amatista que recubren las paredes internas, por lo que primero se debe formar la cavidad . Esto puede suceder en cualquier lugar donde haya o haya lava cerca de la superficie terrestre. Como resultado, las geodas de amatista se pueden encontrar en miles de lugares en todo el mundo. El primer paso en el proceso natural que crea geodas de amatista es la formación de cavidades de gas en la lava. Las cavidades de gas pueden formarse a partir de burbujas (al igual que la carbonatación provoca burbujas en su refresco). Algunos científicos teorizan que las cavidades también se pueden formar al enfriar los flujos de lava cerca de las raíces de los árboles u otras cosas que sobresalen del suelo. La lava refrescante se endurece por completo antes de rellenarse alrededor del afloramiento, creando una cavidad.
Las cavidades se llenan

Las cavidades se llenan con un líquido rico en sílice que contiene trazas de hierro. Con el tiempo, este líquido forma cristales: pirámides de seis lados (romboedros) de amatista. Los cristales con un color que varía de lila claro a morado oscuro se forman cuando hay un rastro de hierro en el líquido, lo que resulta en geodas de amatista.